Akcja powiesci rozgrywa sie w Barcelonie w drugiej polowie XX wieku, ale w retrospekcjach pojawiaja sie lata wczesniejsze. Bohaterem jest Daniel Sempere. Towarzyszymy mu od 10 roku zycia, kiedy to jego ojciec zaprowadza go na Cmentarz Zapomnianych Ksiazek. Od tego momentu zaczyna sie historia Daniela, probujacego odkryc tajemnice zawiazana z autorem jednej z zapomnianych ksiazek - Julianem Caraxem.
Daniel, zauroczony powiescia Caraxa Cien wiatru, probuje odnalezc inne ksiazki jego autorstwa. Okazuje sie jednak, ze wszystkie ksiazki zostaly spalone. Komus zalezy rowniez na zniszczeniu ostatniego egzemplarza, ktory znajduje sie w posiadaniu nastoletniego chlopaka.
Autor wprowadza do powiesci wiele postaci i watkow, ktore, pozornie luzno ze soba zwiazane, na koncu prowadza do rozwiazania zagadki.